Для воплощения реформы в жизнь было значительно изменено и законодательство о железнодорожных перевозках. В частности, в 2003 г. были приняты ФЗ "О железнодорожном транспорте в РФ", новый Устав железнодорожного транспорта РФ (УЖТ), целый пакет приказов МПС России, утвердивших различные правила перевозки грузов. Устав железнодорожного транспорта 2003 г. определяет порядок работы концептуально новой системы организации перевозок на железнодорожном транспорте.

Основными особенностями этой системы являются:
во-первых, разделение перевозочного процесса на два самостоятельных спектра правоотношений - услуги инфраструктуры и перевозки и
во-вторых, возможность функционирования независимых перевозчиков, что обеспечит становление и развитие конкурентной среды в сфере железнодорожных перевозок.

На рынке железнодорожных перевозок выделяются три субъекта - перевозчик, владелец инфраструктуры железнодорожного транспорта общего пользования и пользователь услуг железнодорожного транспорта (грузоотправитель, грузополучатель, пассажир и т.д.). В ранее действовавш ем законодательстве закреплено было только два субъекта (пользователь услуг и перевозчик). Причем перевозчик одновременно являлся и владельцем инфраструктуры.

Несмотря на то что, как отмечалось выше, реально еще не произошло размежевания функций перевозчика и владельца инфраструктуры, ныне действующее железнодорожное законодательство будет способствовать достижению этой цели в будущем.

В качестве перевозчика может выступать любое юридическое лицо и индивидуальный предприниматель, владеющие на праве собственности или на иных законных основаниях железнодорожным подвижным составом и получившие лицензию на осуществление перевозочной деятельности. Перевозчик работает на условиях публичного договора. Грузоотправителем является физическое или юридическое лицо, которое по договору перевозки выступает от своего имени или от имени владельца груза и указано в перевозочном документе. Грузополучатель -физическое или юридическое лицо, управомоченное на получение груза.